1 Составляем семантическое ядро сайта
2 Анализ сайтов конкурентов

3 Внутренняя оптимизация сайта
3.1 Важность контента страницы
3.2 Количество и плотность ключевых слов на странице
3.3 Расположение ключевых слов на странице
3.4 Тег TITLE
3.5 Внутренняя перелинковка сайта
3.6 Файл robots.txt
3.7 Ошибки при оптимизации сайта

4 Индексация сайта поисковыми системами
4.1 добавление сайта на индексацию поисковыми системами
4.2 как ускорить индексацию сайта
4.3 как проверить индексацию сайта поисковыми системами
4.4 как запретить индексацию страниц сайта поисковыми системами
4.5 почему не индексируется сайт
4.6 почему сайты выпадают из индекса ПС

5 Внешняя оптимизация сайта
5.1 Релевантные ссылки
5.2 Анкоры ссылок
5.3 Работа с САПЕ
5.3.1 Создание проекта в САПЕ
5.3.2 Создание фильтров в САПЕ
5.3.3 Поиск площадок в САПЕ
5.3.4 Качественный анализ сайтов доноров
5.3.5 Wizard.Sape - автоматическое продвижение от Sape
5.3.6 PR.Sape - вечные ссылки от Sape
5.4 SeoHammer - уникальный анализ работоспособности доноров
5.5 Продвижение статьями
5.6 Продвижение "вечными" ссылками в GoGetLinks
5.6.1 Создание рекламной компании в Gogetlinks
5.6.2 Поиск сайтов в Gogetlinks
5.6.3 Разбор заявок в Gogetlinks

6 Региональность сайтов
6.1 Как задать региональность сайту
6.2 Геозависимые и геоНЕзависимые запросы
6.3 Как определить запрос геозависимый (ГЗ) или геоНЕзависимый (ГНЗ)

7 Система автоматического продвижения сайтов Сеопульт
7.1 Система автоматического продвижения ROOKEE

8 Поведенческие факторы

9 Приложения

9.1 Словарь SEO терминов
9.2 Необходимый SEO софт

Планирую в скором времени обновление мануала, но и в текущем состоянии есть что подчерпнуть ;)